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新方法预测细菌耐药性基因准确率高。

华盛顿州立大年夜学的钻研职员开拓了一种猜测细菌耐药基因的新措施。经由过程机械进修和博弈论模型,可以猜测三种不合类型革兰氏阴性菌的耐药基因,准确率达93%-99%。

细菌抗衡生素的耐药性已成为影响举世公共卫生的紧张问题,要挟着数亿人。仅在美国,每年就稀有百万人受到抗药性细菌的感染,导致数万人逝世亡。近年来,科学家们不停试图找到一种猜测和剖断抗生素耐药基因的措施,以便更有效地将药物利用于患者。跟着全基因组测序技巧的冲破,他们成长了序列比对措施,经由过程序列相似性来识别抗生素耐药基因。然而,当碰到与已知抗生素耐药基因高度相似的序列时,这些措施有些力所不及。

这一次,华盛顿州立大年夜学的钻研小组抉择使用博弈论来赞助猜测和剖断抗生素耐药基因。博弈论是钻研竞争或斗争征象的数学理论和措施,是现代经济学的标准阐发对象之一。在博弈模型中,一个介入者的行径会影响并依附于其他介入者的行径。

使用该团队开拓的机械进修算法和博弈论模型,我们不仅阐发了细菌基因组中的简单序列相似性,还钻研了蛋白质序列布局、理化特点、进化特点等互相感化。为了准确猜测抗生素耐药基因的组成特性等特点。他们在第九次科学申报中颁发了一篇钻研论文,猜测三种革兰氏阴性菌(假单胞菌、弧菌和肠杆菌)耐药性基因序列的新措施的准确率为93%-99%。

钻研职员说,这种新颖的博弈论措施分外强大年夜。它斟酌到基因特点的相关性和互相依附性,根据它们整体协同事情的能力来识别可能的抗微生物基因,从而识别先前经由过程简单序列比对无法识别的推定抗药性基因。跟着抗生素耐药性的增添和测序基因组的增多,迫切必要开拓新的、更准确的猜测和剖断耐药基因的对象。他们的钻研注解,机械进修模型将是一个紧张的钻研偏向。

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